Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf1P15314 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf1P15314 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf1P15314 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Irf1P15314 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Irf1P15314 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Irf1P15314 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf1P15314 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Irf1P15314 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms