Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd4P10628 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms