Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnmt3cP0DOY1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Dnmt3cP0DOY1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms