Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Col4a2P08122 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms