Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TtrP07309 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TtrP07309 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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