Protein–RNA interactions for Protein: P01849

Tcra, T-cell receptor alpha chain C region, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcraP01849 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TcraP01849 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TcraP01849 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TcraP01849 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TcraP01849 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TcraP01849 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TcraP01849 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
TcraP01849 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TcraP01849 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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