Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01649 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01649 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms