Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01647 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01647 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01647 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms