Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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