Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ccl20O89093 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl20O89093 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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