Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Clec11aO88200 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Clec11aO88200 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Clec11aO88200 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Clec11aO88200 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Clec11aO88200 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clec11aO88200 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec11aO88200 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Clec11aO88200 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms