Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lgals6O54891 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.3 ms