Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csnk2a2O54833 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms