Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FxnO35943 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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FxnO35943 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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FxnO35943 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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FxnO35943 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FxnO35943 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FxnO35943 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FxnO35943 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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