Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms