Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1aO35526 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms