Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk2O35491 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk2O35491 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk2O35491 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk2O35491 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk2O35491 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clk2O35491 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk2O35491 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk2O35491 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Clk2O35491 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk2O35491 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clk2O35491 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk2O35491 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk2O35491 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clk2O35491 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clk2O35491 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms