Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ColqO35348 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ColqO35348 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ColqO35348 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ColqO35348 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms