Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tnfrsf11aO35305 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf11aO35305 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf11aO35305 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf11aO35305 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tnfrsf11aO35305 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Tnfrsf11aO35305 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Tnfrsf11aO35305 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnfrsf11aO35305 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnfrsf11aO35305 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnfrsf11aO35305 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tnfrsf11aO35305 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tnfrsf11aO35305 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf11aO35305 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tnfrsf11aO35305 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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