Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Slc18a3O35304 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Slc18a3O35304 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Slc18a3O35304 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Slc18a3O35304 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Slc18a3O35304 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Slc18a3O35304 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Slc18a3O35304 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Slc18a3O35304 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Slc18a3O35304 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Slc18a3O35304 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Slc18a3O35304 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Slc18a3O35304 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Slc18a3O35304 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Slc18a3O35304 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Slc18a3O35304 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc18a3O35304 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms