Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2f3O35261 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms