Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gm3278L7N2D2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gm3278L7N2D2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm3278L7N2D2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3278L7N2D2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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