Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm3542K7N6U2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm3542K7N6U2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm3542K7N6U2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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