Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm8298J3QPI0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm8298J3QPI0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm8298J3QPI0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm8298J3QPI0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm8298J3QPI0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm8298J3QPI0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm8298J3QPI0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm8298J3QPI0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm8298J3QPI0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm8298J3QPI0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm8298J3QPI0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm8298J3QPI0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm8298J3QPI0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm8298J3QPI0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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