Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim18J3QNP2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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