Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm6176J3QK59 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm6176J3QK59 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6176J3QK59 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm6176J3QK59 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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