Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms