Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20708H3BKF4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20708H3BKF4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20708H3BKF4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20708H3BKF4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20708H3BKF4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20708H3BKF4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20708H3BKF4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20708H3BKF4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20708H3BKF4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20708H3BKF4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20708H3BKF4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20708H3BKF4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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