Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp9yF8VPU6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms