Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Urb2E9Q7L1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms