Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm20518E9Q548 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm20518E9Q548 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm20518E9Q548 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm20518E9Q548 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm20518E9Q548 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm20518E9Q548 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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