Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Irf2bp2E9Q1P8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Irf2bp2E9Q1P8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Irf2bp2E9Q1P8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Irf2bp2E9Q1P8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Irf2bp2E9Q1P8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Irf2bp2E9Q1P8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Irf2bp2E9Q1P8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Irf2bp2E9Q1P8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Irf2bp2E9Q1P8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Irf2bp2E9Q1P8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irf2bp2E9Q1P8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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