Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms