Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms