Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17333C6EQI3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms