Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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