Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfap58B2RW38 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms