Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phf3B2RQG2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf3B2RQG2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf3B2RQG2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf3B2RQG2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms