Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brpf3B2KF05 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms