Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trabd2bB1ATG9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trabd2bB1ATG9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trabd2bB1ATG9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trabd2bB1ATG9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trabd2bB1ATG9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms