Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Skint7A7XV04 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Skint7A7XV04 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms