Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms