Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms