Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtcflA2APF3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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