Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc183A2AJB1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms