Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rbbp8nlA2ABX0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbbp8nlA2ABX0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms