Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf19bA2A7Q9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf19bA2A7Q9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms