Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
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