Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cldn6Q9Z262 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cldn6Q9Z262 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cldn6Q9Z262 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cldn6Q9Z262 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cldn6Q9Z262 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cldn6Q9Z262 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cldn6Q9Z262 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cldn6Q9Z262 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cldn6Q9Z262 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cldn6Q9Z262 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn6Q9Z262 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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