Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sumo3Q9Z172 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms